DOCKING ANALOG KURKUMIN TURUNAN PIPERAZINDION DENGAN TUBULIN (1TUB) RANTAI  MENGGUNAKAN VINA DAN AUTODOCK1

Broto Santoso(1*)

(1) Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Surakarta
(*) Corresponding Author

Abstract

Program Autodock mampu memprediksi energi bebas dan konformasi ikatan antara fleksibel ligan dan makromolekul target yang telah diketahui. Senyawa turunan dan analog kurkumin adalah ligan yang telah banyak dihasilkan dan diuji aktivitasnya. Beberapa diantaranya memiliki khasiat yang lebih baik dari kurkumin. Enam senyawa turunan piperazindion, kurkumin, PGV-0, dan PGV-1 dihitung energi optimasi geometrinya menggunakan density functional theory (DFT) – Gaussian. Ligan hasil optimasi dicari energi ikatan ligan dengan reseptor 1TUB rantai b melalui docking menggunakan Vina dan Autodock dengan metode Lamarckian Genetic Algorithm (LGA), traditional Genetic Algorithm (tGA), dan Simulated Annealing (SA) Monte Carlo. Data energi ikatan (affinitas) terbaik yang diperoleh dianalisis dengan Anova: Two-Factor Without Replication (P=0,01). Hasil docking dengan semua metode menunjukkan bahwa senyawa analog kurkumin turunan piperazindion mempunyai potensi ikatan lebih baik dibanding senyawa induknya

 

Kata Kunci: 1TUB, Autodock, docking, kurkumin, piperazindion

age:IN'>Kata kunci: Citrus reticulata, antiproliferatif, DMBA, AgNOR, c-Myc.

 

Full Text:

PDF
DOI: 10.23917/pharmacon.v12i1.43

Article Metrics

Abstract view(s): 314 time(s)
PDF: 433 time(s)

Refbacks

  • There are currently no refbacks.